Ufffff. Sin tenerla delante o probarla, es difícil decirte algo.
¿Es tu primera Ebike?. Puede ser el mismo arrastre del motor, o que la trasmisión, al ser nueva, tenga esa sensación de rozamiento y te venga de ahí.
Comprueba si es lo mismo en piñones grandes y pequeños, siempre manteniendo la misma cadencia de pedaleo.
Luego haz lo mismo a una cadencia mucho más alta.
Entre una y otra, haz las pruebas con todos los modos.
Si en cadencias bajas, con piñones pequeños, lo notas más que con piñones grandes, podría ser la dentada de los dientes del plato en contacto con los eslabones de la cadena, y hasta que no ceda algo la cadena, lo seguirás notando.
Dale un margen de entre 200-300km a la trasmisión para que todo se ponga en su sitio. Si te desaparece, todo venía de ahí.
Suerte.