Si, pero no es que se recupere, pasa lo siguiente:
Cuando el motor está tirando y la batería está al final de su capacidad, ante cargas baja la tensión (pues aumenta la resistencia interna) y el controlador entiende que la batería está en las últimas
Al apagar y dejar un tiempo, cuando enciendes de nuevo, el controlador verifica la tensión. Como el motor está parado, no hay carga y la tensión está más alta.
En baterías de Li Ion hay una relación entre la tensión en vacio (llamada OCV, open circuit voltage) y el estado de carga, por ello el controlador marca más nivel que el que viste mientras estabas en marcha.