Buenas, quería aportar que ayer cuando me puse a programar el controlador por primera vez tuve también el problema de que no me conectaba la aplicación con el motor. Instale los drivers correctamente, reinicie el pc, y abrí el software de programación como administrador, pero aún así no conectaba. El caso es que como leí que el motor tenía que estar desconectado pues yo quite la batería, pero realmente no se conecta si el controlador no está alimentado externamente, es decir, que no se alimentan por el cable usb de programación. Así que en mi caso y supongo que en el de todos, hay que dejar el controlador alimentado por la batería.
Todavía no he podido probar el resultado de la programación, ya os contaré. Mi controlador tenía configurada la corriente máxima a 24a y mi controlador es de 25a, así que es lo primero que he cambiado.